Произведения Леонардо Да Винчи находятся не только в трапезной при Санта Мария Делле Грацие .Musico — это замечательный портрет друга Леонардо, который даёт более полное представление о технике мастера, хранится в музее Амброзиана. Атлантический кодекс Леонардо да Винчи тоже хранится в Амброзиане. Здесь хранятся ценнейшие произведения: Картоны Рафаеля к ватиканской фреске «Афинская школа», единственная в Милане работа кисти Леонардо да Винчи «Портрет музыканта», восхитительную живопись Боттичелли «Мадонна дель Падильоне», полотно Тициана «Поклонение волхвов».Караваджо «Корзина с фруктами», картины мастеров фламандской школы.
В Картинной галерее Амброзиана можно познакомиться с ценнейшими произведениями эпохи Возрождения Италии и фламандских мастеров.